Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM46AQ96IP4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM46AQ96IP4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM46AQ96IP4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM46AQ96IP4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM46AQ96IP4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM46AQ96IP4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM46AQ96IP4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM46AQ96IP4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM46AQ96IP4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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FAM46AQ96IP4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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FAM46AQ96IP4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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FAM46AQ96IP4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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FAM46AQ96IP4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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FAM46AQ96IP4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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FAM46AQ96IP4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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FAM46AQ96IP4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM46AQ96IP4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM46AQ96IP4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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