Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms