Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD3Q96ES6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD3Q96ES6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms