Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB3CQ96E17 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms