Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC39Q96DD0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227 ms