Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REPS1Q96D71 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REPS1Q96D71 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REPS1Q96D71 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REPS1Q96D71 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REPS1Q96D71 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REPS1Q96D71 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms