Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK4Q96C45 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK4Q96C45 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms