Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC8Q96B26 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms