Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP4Q969X6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTP4Q969X6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.33■■□□□ 1
UTP4Q969X6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UTP4Q969X6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UTP4Q969X6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTP4Q969X6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP4Q969X6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP4Q969X6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP4Q969X6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP4Q969X6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP4Q969X6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP4Q969X6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP4Q969X6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP4Q969X6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP4Q969X6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UTP4Q969X6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP4Q969X6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP4Q969X6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP4Q969X6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP4Q969X6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UTP4Q969X6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP4Q969X6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP4Q969X6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP4Q969X6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP4Q969X6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UTP4Q969X6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP4Q969X6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP4Q969X6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP4Q969X6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP4Q969X6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP4Q969X6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP4Q969X6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP4Q969X6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP4Q969X6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms