Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms