Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms