Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms