Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNPO1Q92973 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNPO1Q92973 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms