Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX13Q92968 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX13Q92968 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms