Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BAP1Q92560 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BAP1Q92560 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms