Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms