Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX92

NELFB, Negative elongation factor B, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFBQ8WX92 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NELFBQ8WX92 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFBQ8WX92 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms