Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms