Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms