Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TRIM41Q8WV44 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC38■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC38■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TRIM41Q8WV44 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms