Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF4Q8WV16 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF4Q8WV16 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms