Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GNPDA2Q8TDQ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNPDA2Q8TDQ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms