Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX54Q8TDD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms