Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM71BQ8TC56 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM71BQ8TC56 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM71BQ8TC56 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms