Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms