Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA4Q8NEY3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA4Q8NEY3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATA4Q8NEY3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms