Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMG8Q8ND04 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG8Q8ND04 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG8Q8ND04 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG8Q8ND04 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG8Q8ND04 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG8Q8ND04 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG8Q8ND04 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG8Q8ND04 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG8Q8ND04 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms