Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC191Q8NCU4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC191Q8NCU4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC191Q8NCU4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC191Q8NCU4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC191Q8NCU4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC191Q8NCU4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms