Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RDH13Q8NBN7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RDH13Q8NBN7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH13Q8NBN7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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