Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COLGALT1Q8NBJ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms