Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms