Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD42Q8N9B4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms