Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7E2

ZNF645, E3 ubiquitin-protein ligase ZNF645, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF645Q8N7E2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF645Q8N7E2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF645Q8N7E2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms