Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms