Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP2Q8IXW5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPAP2Q8IXW5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms