Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NELFCDQ8IXH7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms