Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms