Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC83Q8IWF9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms