Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM139Q8IV31 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM139Q8IV31 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms