Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRLF3Q8IUI8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRLF3Q8IUI8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 372 ms