Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNL1Q8IU54 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms