Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP4Q86YS3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
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