Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALB2Q86YC2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms