Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VPS37DQ86XT2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms