Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2Q1Q7Z7E8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2Q1Q7Z7E8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2Q1Q7Z7E8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms