Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF550Q7Z398 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF550Q7Z398 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms