Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU3

OLIG3, Oligodendrocyte transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OLIG3Q7RTU3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OLIG3Q7RTU3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OLIG3Q7RTU3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms