Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYFIP1Q7L576 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CYFIP1Q7L576 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYFIP1Q7L576 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms