Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2AQ7L0J3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms