Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.392e-7■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 PSMA3-208ENST00000555743 640 ntTSL 26.37□□□□□ -1.392e-7■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.683e-8■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.673e-8■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.623e-8■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.263e-8■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.263e-8■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 DLK1-204ENST00000555747 538 ntTSL 421.57■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 TFRC-204ENST00000421258 524 ntTSL 313.33□□□□□ -0.282e-15■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.196e-69■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.216e-69■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -16e-69■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 CD53-202ENST00000464329 416 ntTSL 26.34□□□□□ -1.391e-8■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.332e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 GLT8D1-210ENST00000484163 1889 ntTSL 528.43■■■□□ 2.142e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 GLT8D1-202ENST00000394783 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 SUN1-231ENST00000480475 680 ntTSL 417.55■□□□□ 0.42e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 SUN1-225ENST00000464442 580 ntTSL 416.09■□□□□ 0.172e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.545e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.525e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.475e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 LGMN-217ENST00000557609 1832 ntTSL 517.65■□□□□ 0.425e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.921e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.547e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 PON3-204ENST00000442770 1127 ntTSL 318.43■□□□□ 0.547e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 PON3-206ENST00000456855 1049 ntTSL 318.43■□□□□ 0.547e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 PON3-202ENST00000418617 1000 ntTSL 318.43■□□□□ 0.547e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 LRRFIP1-215ENST00000498053 593 ntTSL 318.34■□□□□ 0.537e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 MCAM-206ENST00000526992 574 ntTSL 417.99■□□□□ 0.478e-11■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ZMPSTE24-204ENST00000479131 561 ntTSL 417.18■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.327e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.246e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 LRRFIP1-207ENST00000465870 1626 ntTSL 316.2■□□□□ 0.187e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.187e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 CYB5R1-205ENST00000482572 863 ntTSL 515.97■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.057e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.012e-7■■■■□ 21.9
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SND1Q7KZF4 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.157e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 CYB5R1-206ENST00000483915 644 ntTSL 213.91□□□□□ -0.187e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ABCC10-202ENST00000372512 405 ntTSL 312.53□□□□□ -0.47e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 TTC14-203ENST00000412756 4568 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.537e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 TTC14-205ENST00000465065 7052 ntTSL 1 (best)11.12□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 TTC14-207ENST00000470669 3150 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.692e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 CD276-208ENST00000559978 503 ntTSL 210.74□□□□□ -0.697e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 TTC14-201ENST00000296015 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-7■■■■□ 21.9
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SND1Q7KZF4 MIA3-202ENST00000344507 2026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.857e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 TMEM87B-204ENST00000463427 637 ntTSL 39.37□□□□□ -0.917e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ALDH1A1-205ENST00000482210 879 ntTSL 29.16□□□□□ -0.947e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.987e-6■■■■□ 21.9
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SND1Q7KZF4 ALDH1A1-204ENST00000446946 805 ntTSL 58.04□□□□□ -1.127e-6■■■■□ 21.9
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SND1Q7KZF4 PON3-210ENST00000492800 2433 ntTSL 26.24□□□□□ -1.417e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.447e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.676e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 TP53I13-209ENST00000581411 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 329.22■■■□□ 2.274e-8■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.174e-8■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.949e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.849e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-219ENST00000480988 1857 ntTSL 226.04■■□□□ 1.769e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-225ENST00000497235 859 ntTSL 326.02■■□□□ 1.769e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.679e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-212ENST00000467335 990 ntTSL 323.64■■□□□ 1.379e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-215ENST00000473206 821 ntTSL 223.64■■□□□ 1.379e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.299e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.279e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 EIF2B1-206ENST00000543940 423 ntTSL 322.79■■□□□ 1.249e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-226ENST00000497457 1582 ntTSL 1 (best)22.46■■□□□ 1.199e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-214ENST00000470683 752 ntTSL 222.13■■□□□ 1.139e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 EIF2B1-202ENST00000452159 622 ntTSL 222.05■■□□□ 1.129e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 TP53I13-206ENST00000579674 2468 nt22.01■■□□□ 1.114e-8■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-228ENST00000498383 685 ntTSL 221.45■■□□□ 1.029e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-216ENST00000477332 848 ntTSL 321.45■■□□□ 1.029e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 EPHX1-203ENST00000445856 567 ntTSL 220.88■□□□□ 0.931e-11■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 MFAP3-210ENST00000522177 567 ntTSL 420.78■□□□□ 0.929e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.919e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.899e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.879e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.859e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-7■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 CIAO1-202ENST00000469320 565 ntTSL 420.3■□□□□ 0.849e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.89e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 TP53I13-208ENST00000580183 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.22■□□□□ 0.674e-8■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.649e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 ST7L-213ENST00000470519 834 ntTSL 518.95■□□□□ 0.629e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.69e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.69e-6■■■■□ 21.9
SND1Q7KZF4 WDR74-212ENST00000541930 827 ntTSL 518.78■□□□□ 0.69e-6■■■■□ 21.9
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